时下“生物肥”牌子多而杂，再加之有些人总想打着“高科技”的招牌坑农害农，从中渔利，使得广大用户，特别是农民朋友无所适从，有的把只要含有微生物的肥料就诡称为“微生物肥料”、或“微生物菌肥”，也不管该肥料中是含有经正规工艺提纯复壮的真正“功能菌”，还是“有害菌”；有的则把机肥也诡称为“生物肥”或“微生物肥”；还有的不按国家规定随意在包装袋上标注菌数，有的一般产品其菌数含量居然高达每克几百个亿，等等。所以用户和经销商要仔细辨认，国家对微生物肥料的各种指标有严格规定，没把握时应请专家或当地权威部门帮助鉴别，避免上当受骗受损。
那么究竟要如何选择合适的微生物肥料品牌呢？下面是一些值得注意的方面，可供参考：
　　首先对“生物肥”应有较明确的认识。由于多种历史原因，“生物肥”和“微生物肥”这个名称已被滥用了，在市场上，微生物菌肥，菌肥、微生物肥料、微生物菌肥、微生物菌剂、复合微生物菌肥、复合微生物肥料、生物肥均经常被一般人视为同一个东西，实际上它们是有区别的，一般地说，微生物肥料是一类含有生命活力的微生物制剂，具有固氮、解磷或解钾功能，促进作物营养元素的吸收和利用，提高化肥利用率，减少化肥用量，有效恢复地力，减少土壤板结、提高土壤供肥能力，增强作物抗逆性，提高作物产量，改善作物品质的效果。与上述条件基本相符的才能称为“生物肥”或“微生物肥”，而不是凡含有“生物”或“微生物”的“肥料”都能叫做“生物肥”（或“微生物肥”），甚至把一般的有机肥都诡称为“生物肥”或“微生物肥”，这是一个极大的误导，应予注意。
　　其次，产品的技术来源和技术背景要清楚。技术研发背景没个三五年就不切实际地说自己质量如何如何过硬，这是很值得研究的，因为微生物肥料效果检验周期很长，有很多不确定的因素可能导致产品质量难以过关，比如这批产品有效，另一批产品效果可能就打了折扣，今年产品有效，明年后年有的就低效甚至无效了。为什么会产生这种情况呢？因为微生物肥料的“核心”——菌种，它要不断地提纯复壮，一旦功能退化，效果就不行。所以，只有一些较规范的厂商才有条件长期进行筛选和提纯复壮工作，这就是为什么国家规定微生物菌肥从申办临时登记证到转为正式登记证，期间要隔三年的重要原因之一。
　　第三，要选品牌的。只有正规厂家生产的正规产品，其质量和信誉都是有保障的，才是购买和使用的最好选择。
　　第四，要看是否有负面宣传报道，尽量不要选哪些有负面报道的产品，因为“苍蝇不叮无缝的蛋”，因为负面报道多，肯定事出有因，其质量稳定性、厂商信誉、宣传推广等方面估计有问题，应避免选那些产品。